Javier Marcelo Gandolfi, se dio a conocer en la Primera División de Argentina a los 17 años en la Temporada 1998-1999, con River Plate.
En el primer semestre del 2003 se marchó a Talleres de Córdoba. En la Temporada 2003-2004, Gandolfi pasó a préstamo a Arsenal de Sarandí donde tuvo regularidad. Pero cuando se acabó el préstamo volvió a River, donde fue más tenido en cuenta que en sus primeras temporadas.
Más tarde, en la Temporada 2005-2006 volvió a Arsenal de Sarandí, donde otra vez tiene más continuidad. Con el conjunto de Sarandí se consagró Campeón de la Copa Sudamericana 2007 y luego Campeón de la Copa Suruga Bank 2008, convirtiéndose en un histórico del cuadro de Sarandí.
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Gandolfi, fue el primer refuerzo de Talleres de Córdoba para la Temporada 2016-2017, en el torneo de Primera División.10 A lo largo de la temporada logra consolidarse junto a Juan Cruz Komar como centrales titulares en Talleres, cumple los objetivos propuestos por el club y al final de la temporada renueva su vínculo contractual con Talleres.11El 9 de febrero del 2021, a través de las redes sociales, Talleres confirmó que Gandolfi se retiraría del fútbol después de 22 años de trayectoria.
Como asistente o técnico en propiedad, no ha ganado títulos, pero tiene un buen porcentaje de rendimiento. En Talleres de Córdoba, entre 2022 y 2023, estuvo al frente en 62 partidos (30G, 18E, 14P) para un 58,1 %; ya en Independiente del Valle durante 2024 obtuvo un desempeño de 62,3 % luego de 25 triunfos, once empates y diez derrotas.
Cabe recordar que iniciando el año, el ahora anterior técnico, Efraín Juárez, hizo oficial su renuncia, luego de haber salido campeón de la Copa Colombia y la Liga Betplay. Juárez, recibió el premio al mejor director técnico por parte de Acolfutpro.
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